Στόχος του Μουσείου Ελιάς Βουβών είναι να διασώσουμε και να αναδείξουμε όλα τα στοιχεία της ζωής των κατοίκων μας, αλλά και των κατοίκων των λοιπών  περιοχών της Κρήτης και της χώρας μας, τα σχετικά με το δένδρο της ελιάς, σε όλο το φάσμα της σχέσης με το δένδρο αυτό, από τη φύτευση, την καλλιέργεια του εδάφους, το κλάδεμα, τη συλλογή του πολύτιμου καρπού του, την αποθήκευσή του, τη  μεταφορά του  στο ελαιουργείο, την έκθλιψή του, κλπ. Επίσης, τη χρησιμοποίησή του στη διατροφή, αλλά και στις εορτές  και εκδηλώσεις, στη βράβευση  των αθλητών καθώς και των νικητών, σαν στοιχείο δόξης, καθώς και τη γενικότερη σχέση με το δένδρο σαν βασικό στοιχείο ομορφιάς, ειρήνης, φιλίας και πολιτισμού.